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Este canal, ASIC1a, asics nimbus 20 fue solo el primer miembro de una pequeña familia de canales H -gated. Gracias al trabajo reciente en muchos laboratorios, ahora tenemos una imagen más clara de la función fisiológica de estos canales con H y hay claros indicios de que los ASIC contribuyen al resultado de varios estados fisiopatológicos. ASIC1a había sido clonado por su homología con la amilorida. -sensible canal de Na epitelial (ENaC), con el que comparte aproximadamente el 25% de identidad de secuencia de aminoácidos [3]. Otros homólogos de ASIC incluyen canales activados por péptidos de pólipos [4] y moluscos [5] y canales mech-anosensibles (las degenerinas o canales "DEG") de C. elegans [6].
Las secuencias de aminoácidos de ASIC seleccionados se alinearon y el árbol para el cladograma se estableció mediante la unión de vecinos usando ClustalX (software DNAstar); las secuencias en los extremos N y C se habían eliminado. La forma relacionada rata del canal de Na cerebro-hígado-intestino (BLINaC) [156] se incluyó para la comparación. B) Árbol asics running filogenético del filo cordado. Se muestran los principales clados cordados. El color corresponde al color de los ASIC de los organismos de estos clados en (A). Hasta el momento, no se han reportado ASIC de cefalocordados y anfibios; su existencia en estos clados es, sin embargo, probable.
La topología transmembrana de la ENaC relacionada se había zapatillas asics running hombre establecido en tres estudios independientes [37 - 39] y reveló que los dos términos se encuentran en el citoplasma, mientras que el dominio entre los dos dominios hidrofóbicos, cada uno de los cuales abarca la membrana una vez, forma un dominio extracelular grande (ECD). Se confirmó que los ASIC tienen la misma topología transmembrana [40] (Figura 2B). El primer exón, que es diferente entre ASIC1a y ASIC1b, comprende el N-terminal intracelular, el primer dominio transmembrana (TMD) y aproximadamente el primer tercio de la ECD (Figura 2A).
TMD2 se enfrenta al poro iónico, los tres residuos (GAS) que probablemente forman la parte selectiva de iones del tamiz molecular [53, 55, 59] asics gel se magnifican en los residuos insertados dentro del extremo N intracelular que se han implicado en contribuir a los poros internos de ASIC1a [65] o ASIC2 [66] están marcados en el recuadro en azul oscuro y claro, respectivamente. Los aminoácidos en esta región también determinan la permeabilidad al Ca 2 de ASIC1a [18]. Se muestra la secuencia de aminoácidos de ASIC1a de rata. Los dos aminoácidos invariablemente conservados (H-G) en el extremo N citoplasmático que están involucrados en la activación de ENaC [67, 68] están marcados en naranja.
Por lo tanto, la columna vertebral de la marea pep se enfrentaría a la luz del filtro de selectividad y ayudaría a coordinar los iones permeables; Una situación similar se encuentra en el bucle P de los canales K. La entrada interior al poro ASIC está mucho menos caracterizada [66]. Sorprendentemente, el segundo TMD es idéntico entre ASIC1a y ASIC1b, aunque ASIC1a es permeable al Ca 2 mientras que ASIC1b no lo es [19]. La diferencia en la selectividad de Ca 2 se ha atribuido a los diferentes terminales N intracelulares [19], lo que sugiere que esta parte de la proteína ayuda a dar forma a la estructura del poro iónico, tal vez por efectos alostéricos de largo alcance.
Otros estudios también demuestran un papel para el extremo amino terminal en la selectividad iónica [67] y la participación en el poro zapatillas asics mujer running interno [66] de ASIC (Figura 2B). Dos aminoácidos (His-Gly) en el extremo N intracelular (Figura 2B) se conservan invariablemente en todos los canales DEG / ENaC. Además, su distancia al comienzo de la primera TMD (aproximadamente 15 aminoácidos) está dentro de uno o dos aminoácidos invariables, lo que sugiere que estos dos aminoácidos tienen alguna función crucial para todos los canales DEG / ENaC. En ENaC, estos dos aminoácidos más unos pocos aminoácidos circundantes, que también son similares en toda la familia de genes, son cruciales para la activación de este canal [68, 69], que define un "dominio de activación".
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